機電學院設有兩辦(院辦和總支辦)、五個系(機械工程系、汽車工程系、電氣信息工程系、農業工程系和物理與電子科學系)、三個研究所(農業工程、機械工程及其自動化和汽車工程研究所)，以及汽車駕駛員培訓部。
目前全院教職工100人，其中教授11人，副教授24人，國家有突出貢獻專家1人，獲得博士學位8 人。本院下設機械設計制造及其自動化、農業機械化及其自動化、電氣工程及自動化、車輛工程、電子科學與技術五個本科專業和汽車運用與維修、電子信息技術、數據庫管理、WEB應用程序設計四個專科高職專業。現有在院研究生和普通本專笠學生1400多人，機械設計制造、農村機電函授和自考學生200多人。
福建農林大學機電工程學院熱忱歡迎高層次人才到我院工作，熱忱歡迎優秀高畢業生報考我院有關專業，熱忱歡迎用人單位到我院聘用畢業生。