日本的學年度為每年4月1日至次年3月31日。第一學期4月1日至9月30日，第二學期10月1日至次年3月31日。假日為周末休息日和法定節假日，以及5月1日大阪大學建校日。每年有春假、暑假、寒假。春假一般是4月初休假，假期10天左右。暑假常為8月初到9月底，寒假一般是12月底到1月初，假期同為10天左右。
本科學制一般為4年，醫學科、牙科醫學以及藥學科需要6年，所有的新生和大二學生都要在豐中校園接受共同的科目教育;在大學院學習2年，完成博士前期課程，可以取得碩士學位;再學習3年，完成博士后期課程，可以取得博士學位。醫學研究所(醫科學專業除外)、牙醫學研究所在讀完本科6年的基礎上，再攻讀4年，可以直接取得博士學位。生命機能研究所為5年一貫制課程，完成學業直接取得博士學位。高等司法研究院為專門職大學院，標準學習時間3年，完成學業取得法務博士學位。