2016年馬來西亞有5所大學進入了usnews世界大學排名的榜單，比去年新增兩所。馬來亞大學(Universiti Malaya)仍然是馬來西亞唯一一所進入世界前500名的大學，2015年排423名，2016年排422名，前進了一名。
2016馬來西亞大學入榜的五所大學分別是：
馬來亞大學(Universiti Malaya)
馬來西亞理科大學(Universiti Sains Malaysia)
馬來西亞博特拉大學(Universiti Putra Malaysia)
馬來西亞科技大學(Universiti Teknologi Malaysia)
馬來西亞國民大學(Universiti Kebangsaan Malaysia)
2016新入榜單的兩所大學分別是：馬來西亞科技大學(Universiti Teknologi Malaysia)和馬來西亞國民大學(Universiti Kebangsaan Malaysia)。這兩所大學在各種亞洲大學排名榜單中都常常排在前100名的位置。